Powikłania po aborcji farmakologicznej to standard. Mimo że taka opcja jest już od lat, to po spożyciu tabletek nadal pojawia się wiele komplikacji. Standardowym efektem ubocznym aborcji farmakologicznej jest perforacja macicy i niecałkowita aborcja, która zmoże doprowadzić do mocnego krwotoku i infekcji. Stąd też w prawie wszystkich przypadkach po aborcji farmakologicznej obowiązkowe jest udanie się do lekarza celem usunięcia resztki tkanki z macicy.